中国中医科学院下设11个研究所、4所医院及研究生部、中医古籍出版社、中医杂志社等学术单位；与世界卫生组织共同建立了临床与信息、针灸、中药三个传统医学合作中心。世界针灸学会联合会、中国中西医结合学会和中国针灸学会总部均设在中医中医研究院。

　　中国中医科学院现有职工3824人，各类专业技术人员3188名，其中高级职称者852名。全院占地面积33.5万平方米，建筑面积30.8万平方米，是目前我国规模最大、学科齐全、设备先进、科研力量雄厚的中医药研究机构，在国际传统医学界具有很高的学术地位和重要的影响。